黃曲黴和寄生曲黴是產生黃曲黴毒素的最重要的菌株。此外,青黴菌屬、毛黴屬、鐮孢菌屬、根黴屬和鏈黴菌屬的黑曲黴、灰綠曲黴、赭曲黴、桔青黴、擴展青黴和指狀青黴也能產生黃曲黴毒素。它們產生黃曲黴毒素的條件如下:底物、溫度、pH和相對濕度。