腐乳中鹽和嘌呤的含量普遍較高。高血壓、心血管疾病、痛風、腎病、消化道潰瘍患者應少吃或不吃，以免加重病情。
另外，發酵後發臭的腐乳容易被微生物汙染，豆腐中的蛋白質被氧化分解產生含硫化合物。臭豆腐吃多了，對身體有不良影響。