蕎麥皮枕頭在潮濕的環境中容易發黴受潮，從而引起蟲蛀。此外，在加工制作蕎麥枕時，如果蕎麥粉顆粒去除不徹底，也會滋生昆蟲。日常使用中要註意蕎麥枕的清潔保養，如定期清洗、殺菌等。，並經常晾曬以保持枕頭幹燥，避免蟲蛀。
如果枕頭有蟲，可以先用噴霧抑制生長，再進行蒸煮、殺菌、清洗。