公元前501年正月，康王開始給郭襄打電話。這時，蕭炎被任命為征東將軍，蕭炎親自率領大軍從襄陽向建康進發。蕭炎把弟弟肖偉留在永州，任永州刺史。當時，永州的兵力和倉庫都很空虛，其他城市的太守拒絕服從蕭炎進攻襄陽的命令。
因為當地太守不聽蕭炎的命令，蕭炎無法進攻。這時，肖偉和程瀟派兵反擊，壹舉拿下敵人。此時，原本危機四伏的永州恢復了平靜。就在他們包圍建康的時候，荊州危機四伏。當時巴東太守魯修攻打江陵，肖偉隨機率領永州兵馬去救援江陵。肖偉在這場戰役中立下了汗馬功勞，與蕭寶榮皇帝壹起被封為鎮北大學士。
建安元年，肖偉再次被封為建安王。十六年後，梁武帝因建安土地貧瘠，改原建安王肖偉為南平郡王。後來，肖偉擔任徐州和江州刺史。後因年老多病回京，歷任傅、中書、光祿等要職。但回京後，肖偉信奉了佛教。
晚年，肖偉迷信自己的重病。攻打建康時，因為軍費問題，他破壞了向陽寺的壹些佛像。肖偉命令人們殺死他們。據說肖偉因為這件事成了噩夢，他的病體越來越差，人們開始迷信，開始拜佛。