木薯澱粉有變性澱粉和原生澱粉兩種，廣泛應用於食品工業和非食品工業。變性澱粉可根據用戶提出的具體要求進行定制，以適應特殊用途。
還可以與石油基或合成高分子材料混合，提高材料的生物降解性，降低這類環保材料的生產成本。木薯澱粉和玉米澱粉不同，玉米澱粉顏色較深，木薯澱粉是白色的。玉米澱粉的口感和性質是紅薯不能比的。
木薯澱粉，天然的強筋原料，吃起來像紅薯澱粉壹樣綿軟，有紅薯的香味。玉米澱粉顆粒較小，需要膨脹到壹定程度才能產生粘性。所以粘度略高，其幹燥速度較慢。它的膏體是濕的，壹般來說膏體用量略高。
使用區別
木薯澱粉顆粒較大，微漲，糊會發粘，所以粘度略低。它的幹燥速度比較快，所以它的膏體是幹的。總的來說，它的膏體用量略低。玉米澱粉純度很高，可以作為家常菜的增稠劑。作為原料，可直接用於制作粉條、肉制品、冰淇淋等。
也用於醫藥，是制造葡萄糖的重要原料。木薯澱粉主要是用來使湯汁更濃，適合制作需要精細調味的食物，如蛋糕、布丁或糕點等。可用於制作味精、麥芽糖、果糖、餅幹等食品。它具有高粘度，可用作增稠劑、粘合劑、填充劑和穩定劑。