北京大學第三醫院麻醉科在金清塵教授、蔣建渝教授、張利萍教授等專家的領導下十幾年來蓬勃發展。從2009年5月起，原協和醫院麻醉科副主任郭向陽教授成為科室新的學科帶頭人。北醫三院中心手術室有19個手術間及2個麻醉後恢復室，另外還在生殖中心、內鏡中心、中央黨校院區等有分散手術區域6個。每個手術間都配有進口全能麻醉機、進口呼吸機和監測設備。除對病人進行常規監測外，還有多種設備可進行麻醉氣體、有創壓力、BIS、肌松及心輸出量監測。
北醫三院每年完成的手術量都位於北京市三甲醫院的前5位。2008年完成麻醉例數約26000例，其中全身麻醉占46%，大、中型手術及復雜、疑難伴發疾病手術麻醉占全部麻醉40%左右。麻醉科還開設術前訪視和疼痛治療門診。
麻醉科壹向重視教育教學工作，科室中有多名教師榮獲各級優秀教師稱號。北醫三院麻醉科為北京市專科醫師培訓基地及專科醫師考核基地。北醫三院麻醉科從90年代起常年面向全國範圍招收進修醫生，在進修醫師的培養方面富有經驗。