在劇情設計上，《萌妻食神》巧妙地將古代中華美食和現代美食元素相結合，使得整個故事既有濃厚的歷史氣息，又充滿了現代感。葉佳瑤的古靈精怪和精湛的廚藝，以及夏淳於的深情厚意，構成了壹段跨越時空的愛情。同時，動畫中的各種美食描繪也十分到位，讓人看得口水直流，非常符合該片的主題。
此外，《萌妻食神》在制作上也下足了功夫。據制作公司表示，他們在制作流程上更加精細，壹些原畫表演都做了真人預演，尤其是壹些做菜的刻畫。這也使得該片在國產動畫中具有壹定的亮點。
總的來說，《萌妻食神》的劇情設計既符合原著小說的精神，又在動畫化過程中進行了壹定的創新，是壹次較為成功的改編嘗試。