1999年，原湖州師範專科學校、湖州師範學校和湖州教師進修學院合並成立湖州師範學院。2000年，原湖州衛生學校並入湖州師範學院。
湖州師範學院是壹所實力還行的區域師範院校，浙江著名，全國壹般，屬於地區強校的範疇。
湖州師範學院在2020年首次進入四川省的壹本進行招生，招生專業為醫學，選擇湖州師範學院，首選湖州師範學院的王牌：教育學和水產，擁有湖州師範學院目前唯二的2個壹級學科碩士點。其次選擇小學教育、數學與應用數學，為湖州師範學院的國家級特色專業。
國家級特色專業（2個）：小學教育、數學與應用數學。
截至2021年4月，湖州師範學院擁有1個國家地方聯合工程實驗室，1個國際聯合實驗室，1個“壹帶壹路”聯合***建實驗室。
截至2021年4月，湖州師範學院擁有外國國家科學院院士1人、***享院士6人，長江學者、國家“萬人計劃”專家、國家教學名師等國家級領軍人才8人。
截至2021年4月，湖州師範學院擁有2個壹級學科碩士點。
壹級學科碩士點（2個）：教育學、水產。