截至2018年，肥東縣下轄13個鎮，6個鄉，店埠鎮、撮鎮鎮、梁園鎮、橋頭集鎮、長臨河鎮、石塘鎮、古城鎮、八鬥鎮、元疃鎮、白龍鎮、包公鎮、陳集鎮、眾興鄉、張集鄉、馬湖鄉、響導鄉、楊店鄉、牌坊回族滿族鄉。
1、店埠鎮
店埠鎮，隸屬於安徽省合肥市肥東縣，是合肥市的衛星城，肥東縣的縣城，距合肥市區僅12公裏，店埠河中遊，總面積147.8平方千米（2017年）。
2、撮鎮鎮
撮鎮鎮，隸屬安徽省合肥市肥東縣，位於合肥市東郊，南瀕巢湖，北連肥東縣城店埠鎮，西接瑤海區大興鎮，轄10個村，3個工業區。是肥東縣南部地區的政治、經濟、文化、商貿和交通中心。
3、橋頭集鎮
橋頭集鎮，安徽省合肥市肥東縣轄鎮，位於肥東縣東南部沿山壹帶，距省城合肥22公裏，東與巢湖接壤，地理位置優越，有山鎮之美稱。
4、白龍鎮
白龍鎮位於安徽省肥東縣，隸屬於安徽省合肥市肥東縣。位於安徽省合肥市肥東縣西北部，地處江淮分水嶺，白龍水庫東側，北與定遠縣接壤，西北與長豐縣毗鄰。
5、包公鎮
包公鎮，隸屬安徽省合肥市肥東縣，是北宋著名清官龍圖閣大學士包拯的出生地。2006年，在鄉鎮建制調整過程中，由原解集鄉、高亮鄉合並而成，鎮址在小包居委會解集大街。
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