辣椒營養很豐富，蛋白質、脂肪、胡蘿蔔素、維生素C、維生素P和鈣、磷、鐵的含量均不少。其中維生素C的含量，為所有蔬菜之首，每百克鮮辣椒含有320mg，壹人壹天只要吃上60g鮮辣椒，就可以滿足身體對維生素C需求了。維生素C還能軟化血管，是中年人防治心血管病的理想蔬菜。
辣椒有很好的健胃作用，少量的辣椒即可促進胃液分泌，增加胃腸蠕動，從而增進食欲，有利於消化，這也是辣椒所以誘人喜食的原因之壹。姚可成在《食物本草》中概括了辣椒的保健作用：“消宿食，解結氣，開胃口避邪惡。”辣椒還有溫中散寒作用。現代藥理研究證明，辣椒能加速血液循環，使皮膚血管擴張，提高皮膚溫度，所以在寒冷潮濕地區人們對辣椒懷有特殊的感情。傷風感冒，關節疼痛，受潮感寒時，吃些辣椒出身汗，癥狀隨著發汗可以消失。四川人夏天吃毛肚火鍋，邊吃邊出汗，認為這是壹種特殊的美食享受。在湖南有“三個紅辣椒，頂個大棉襖”的諺語。從另壹角度說明了辣椒的驅風行血之功。辣椒還是抗壞血酸和胡蘿蔔素的天然倉庫，在蔬菜中抗壞血酸最高要數辣椒，胡蘿蔔素僅次於黃胡蘿蔔。近代醫學證明倆者都具抗癌作用，能“療噎膈”，減少胃癌的發病率。辣椒還含有較高的鈷，鈷是人體合成維生素B12的必需原料，具有促進造血的作用；還能降低血壓，抑制惡性腫瘤細胞的生長，促進脂肪代謝，有減肥及減少血管硬化、冠心病發病率的作用。
但是應該註意，辣椒的刺激性很強，過量食用不僅刺激胃粘膜，還可引起胃腸粘膜充血，甚至引起痙攣。陰虛火旺的人，或患有牙齦病、眼病、上呼吸道感染、咽炎、痔瘡等癥時，應少食或不食。還有經常失眠者不宜食用，因其所含番椒油有興奮神經的作用。兒童不宜多食。患胃潰瘍、胃炎、痔瘡者應慎食。
辣椒不宜與蘿蔔、木瓜同食。