歷史上第壹次出現“十六鋪”的名稱是在清朝鹹豐、同治年間，歷史約為1.4年。它是為了抵禦當時太平軍的進攻而建立的，上海在對外防禦中也建有聯防商店。店鋪負責店內治安，業務由各商號共同承擔。
當時十六鋪是整個地區最大的，涉及範圍很廣，所以十六鋪成為壹個地名壹直沿用至今。
據史料記載，清朝乾隆以後，海禁逐漸開放，上海港的地理位置十分優越，是中國國內南北航運貿易的連接點。此時十六鋪地區已經是中國最大的港口。
2010上海世博會前，十六鋪碼頭已改造三年，如今十六鋪擁有公共濱江綠地、大型商業餐飲、大型停車庫等多種功能。
有三棟體量不大、線條簡單的小樓，不超過四層樓高，周圍有很多綠色親水平臺。