南京航空航天大學***有三個校區。分別是：
1.將軍山校區
將軍山校區位於南京市江寧區，占地面積約1920畝。該校區的主要功能是人才培養和科學研究。該校區設有15個學院，其中包括航空航天與力學學院、能源與動力工程學院、電子信息工程學院等。
2.明故宮校區
明故宮校區位於南京市玄武區，占地面積約139畝。該校區融匯了中國傳統文化元素，建築風格古樸典雅。主要用於學生課余時間的文化活動、體育鍛煉以及社團活動等。
3.河海校區
河海校區位於南京市江寧區，占地約1200畝。該校區主要用於駕駛員、空乘人員、導航人員等的培訓和實驗室使用。河海校區獨有的教學資源、科研平臺和實踐基地，使得學生核心素質和綜合技能的培養更具優勢。