碘的功能都是通過甲狀腺素來完成的，尚未發現碘具有獨立的生理功能。因此下面介紹的碘的生理功能其實就是甲狀腺素的生理功能。
1、促進能量代謝：促進物質的分解代謝，產生能量，維持基本生命活動。
2、維持垂體的生理功能。
3、促進發育：發育期兒童的身高、體重、骨骼、肌肉的增長發育和性發育都有賴於甲狀腺素，如果這個階段缺少碘，則會導致兒童發育不良。
4、促進大腦發育：在腦發育的初級階段(從懷孕開始到嬰兒出生後2歲)，人的神經系統發育必須依賴於甲狀腺素，如果這個時期飲食中缺少了碘，則會導致嬰兒的腦發育落後，嚴重的在臨床上面稱為“呆小癥”，而且這個過程是不可逆的，以後即使再補充碘，也不可能恢復正常。
二、碘過量的危害：
碘攝入過量對人體健康的危害主要包括以下幾個方面：
1、高碘對甲狀腺功能的影響最常見的是碘致甲狀腺腫(IH)和高碘性甲亢。
2、高碘對智力的影響碘過量與智力之間的關系僅在近幾年才引起了專家學者們的重視。多項在人群中開展的流行病學調查都顯示高碘地區學生的智商明顯低於適碘區。大部分動物實驗研究也已證明過量碘負荷確實可使動物腦重量減輕，學習記憶力下降，雖然這種影響不如碘缺乏的作用明顯。
3、高碘對性功能的影響美國的壹項研究曾顯示碘鹽的攝入量與男性精子計數有壹定的關系，提示美國人食用碘鹽可能導致男子的精子計數減少。此外，尚有碘過量對大鼠生殖力影響的多次報道，這不能不說是過量補碘帶給我們的另類擔憂。
三、碘缺乏的危害：
碘缺乏危害是由於自然環境碘缺乏造成機體碘營養不良所表現的相關疾病或危害的總稱。它包括孕婦流產、早產、死產和胎兒先天畸形、地方性甲狀腺腫、克汀病和亞克汀病、單純性聾啞、智力發育和生長發育損害等。成人缺碘將影響甲狀腺激素合成，導致身體機能失調。