武夷山地區植物資源豐富。地帶性植被為常綠闊葉林，主要有殼鬥科、樟科、木蘭科和胡頹子屬，還有大面積的人工杉木林、馬尾松林和毛竹林，還有許多珍稀古老樹種，如銀杏、花萼、鵝掌楸、天女木蘭、銀樹種、半楓荷、花楸、竹節參等。植被的垂直變化也很明顯。以黃崗山為例:海拔1100米以下為常綠闊葉林，主要樹種有甜櫧、栲樹、栲樹、黧蒴栲、木荷、紅楠、木荷。有馬尾松林、杉木林、毛竹林和杉木、馬尾松、毛竹混交林。1100 ~ 1800米為針葉林，包括黃山松林、柳杉林和南方鐵杉林；1800 ~ 1900米為亞高山矮林。主要樹種有沙柳、小葉黃楊和黃山松。1900米至山頂為山地草甸，由野草、沼草、芒、野古草等草類和黃山松、江南柳、毛豆瘦梨、波緣紅樹、明礬華山、箭竹等幼齡灌木組成。野生動物資源也很豐富，國家重點保護的珍貴動物有華南虎、獼猴、果子貍、蘇門羚、雲豹、馬冠鹿、穿山甲、鴛鴦、黃腹錦雞、白頸雉等。昆蟲特別豐富，在中國32目中占31目。還有舉世聞名的金鳳蝶。為了保護動植物資源，在武夷山山脈北段建立了武夷山自然保護區。武夷山山脈東、西麓的紅層發育了丹霞地貌、碧水青山、奇峰怪洞，成為美麗的風景點，其中以武夷山市南郊的武夷山風景區最為著名，有“秀甲東南”的美譽。武夷山區是第二次國內革命戰爭時期的革命根據地。主要革命紀念地有紅都瑞金(見瑞金縣)和閩北人民革命根據地崇安縣的金奎大街、赤石暴動遺址。
武夷山西部是全球生物多樣性保護的關鍵區域，擁有世界上同緯度地帶現存最完整、最典型、最大的原始森林生態系統。東方山水完美結合，人文與自然有機融合。它以其美麗的風景、悠久的歷史文化和眾多的文物古跡而享有盛譽。中部是連接東西部、涵養九曲河水源、保持良好生態環境的重要區域。
鑒於武夷山的自然和文化資源具有上述突出意義和普遍價值，中國市政府建議武夷山申報世界自然和文化雙重遺產。武夷山於1999年2月被聯合國教科文組織列入世界遺產名錄，成為全人類的財富。