現代醫學研究發現，黃花菜營養價值很高，是壹種很好的蔬菜。中醫也認為黃花菜有很高的藥用價值。經常吃壹些黃花菜有助於預防疾病和增進健康。
黃花菜營養極其豐富。從唐代開始，黃花菜就被視為海員的必備蔬菜。經過幹燥脫水後，非常便於攜帶，在海上長時間航行也不會變質，而且食用後還能給人們帶來豐富的營養，所以它和木耳壹樣，是海員出海時必須攜帶的食物之壹。
現代醫學研究發現，黃花菜含有豐富的維生素B1、B2、維生素C、維生素E等營養物質，在蔬菜缺乏的寒冬季節，能為人體補充足夠的維生素。
黃花菜還含有豐富的蛋白質、膳食纖維和鉀、鈣、鎂、鐵、錳、鋅、磷、硒等礦物質元素，食用後有助於人體營養平衡。
黃花菜還含有壹些生物活性成分，如胡蘿蔔素、煙酸，甚至壹些植物雌激素，對人體健康有重要作用。
百合也可以入藥。莉莉在民間有很多化名。有人稱之為無愁少女，意思是可以幫助人忘記煩惱。有些人稱之為“伊曹曼”，意思是它可以幫助生男孩。這些名字大多是善意的象征，也顯示了黃花菜的藥用價值。
中醫認為黃花菜性寒味甘，入肺脾經，具有清熱解毒、祛濕散熱、健脾養血、消食化積等壹系列功效。清代曾經有壹位中醫名醫，主要用黃花菜，與其他十種藥物配伍，制成忘憂湯，用於治療因悲傷過度引起的咳嗽、吐痰等肺部疾病。黃花菜在壹些藥典裏也是作為催乳的藥，所以壹些傳說中的名字還是有壹定道理的。
新鮮黃花菜的花蕊中含有大量秋水仙堿，可使人中毒，輕則惡心、頭痛、腹瀉，重則呼吸不暢、出血，危及生命。所以，新鮮黃花菜要去除雄蕊，高溫煮沸，分解秋水仙堿。人們平時吃的幹黃花菜，經過處理消除了毒性，可以放心食用。