1、主要成分不同
健脾丸：主要成分為黨參、白術（炒）、陳皮、枳實(炒)、山楂(炒)、麥芽(炒)。
人參健脾丸：人參、白術(麩炒)、茯苓、山藥、陳皮、木香、砂仁、炙黃芪、當歸、酸棗仁(炒)、遠誌(制)。
2、功能主治不同
健脾丸：重健脾開胃，具補氣健脾，理氣消食之功效。用於脾胃虛弱，脘腹脹滿，食少便溏。方中黨參、白術補氣健脾；陳皮利氣；山楂消肉食；麥芽消谷食；枳實消積化痞。佐以黨參、白術，則為功更捷，而又不致傷氣；諸藥***奏健脾開胃之功。
人參健脾丸：重用黃芪、山藥，意在健脾益氣，和胃止瀉。用於脾胃虛弱所致的飲食不化、脘悶嘈雜、惡心嘔吐、腹痛便溏、不思飲食、體弱倦怠。方中人參、茯苓、白術、黃芪益氣健脾；山藥、陳皮、砂仁健脾和胃；木香理氣健脾，調理中焦氣機；酸棗仁、遠誌安神定誌；當歸活血養血。諸藥***奏健脾益氣，和胃止瀉之功。
3、禁忌人群不同
健脾丸：有高血壓、心臟病、肝病、糖尿病、腎病等慢性病嚴重者。以及兒童、孕婦、哺乳期婦女、年老體弱者應在醫師指導下服用。
人參健脾丸：感冒發熱病人不宜服用。
二、健脾丸和人參健脾丸哪個好
健脾丸和人參健脾丸都是理氣消食的中藥，但二者相比較，人參健脾丸作用更強。人參健脾丸含有理氣導滯的木香和砂仁，補血活血的當歸，安神斂汗的酸棗仁和遠誌，所以，人參健脾丸功效上比較發散，除了健脾理氣之外，也能養血安神。而健脾丸含有炒枳實、炒山楂和炒麥芽，所以，健脾丸在功效上比較專註，主要就是脾虛伴有食積的問題。