1、生化妊娠
生化妊娠是指精卵已經結合了，但是沒有遊到子宮腔內著床，或者是遊回來了沒有成功著床，稱為“隱性流產”。壹般在妊娠5周內的流產，血中可以檢測到HCG升高超出正常值或者尿妊娠試驗陽性，但超聲檢查看不到孕囊，也被稱為“亞臨床流產”。患者通常無其他癥狀，就像來了例假樣，所以經常被忽視。
2、胚胎發育異常
如果胎兒發育異常會自然流產，其中大多數是染色體異常，有數據顯示，早孕期流產或胎停的病例，有50-60%是染色體異常。專家建議，如果發現褐色分泌物，應該在除外宮頸等生殖器發育異常或病變後，順其自然，不要隨意保胎，否則到後期，還是會出現更大的問題。
3、宮頸異常
最常見的宮頸糜爛，如果有性生活（很多人並不知道懷孕）後次日出現褐色分泌物，應該考慮是宮頸糜爛。其次宮頸息肉，也會導致出血，而且會持續不斷，更應該註意的是蛻膜息肉，是妊娠後特有的息肉而且比宮頸息肉更容易出血並持續長時間出血直至孕中期，這種息肉不能手術切除，否則會導致流產或出血不止。所以，早孕期褐色分泌物，先去婦產科看看宮頸。
雙子宮或殘角子宮等畸形，正常子宮妊娠後，異常的子宮內膜會隨著增厚而出現少量出血，所以，早孕期懷孕出血，超聲檢查必不可少。
4、子宮內膜脫落
由於個體差異等原因，有些女性懷孕後卵巢分泌的性激素尤其是孕激素水平比較低，導致壹小部分子宮內膜繼續脫落，因此這部分女性懷孕後依然會來月經，只是月經量要比正常時期少很多。直到妊娠三個月後，胎盤形成了，女性體內的雌激素、孕激素維持在壹個比較高的水平，這時子宮內膜不再脫落，月經也就不再來了。
5、宮外孕
是指孕卵在子宮腔外著床發育的異常妊娠過程。宮外孕常有不規則陰道出血，色暗紅、量少、淋漓不盡，壹般不超過月經量，隨陰道出血可排出蛻膜管型或碎片。宮外孕的危害極大，受精卵不但不能發育成正常胎兒，如果不能及早發現宮外孕癥狀並處理的話，有可能危及生命。