荸薺蓮有毒，含有大量草藥鈣晶體和生物堿。誤食會出現嗜睡等中毒癥狀。本種為中國植物學圖譜數據庫收錄的無毒植物，毒性為塊莖、佛焰苞、穗狀花序。咀嚼小塊莖會導致舌頭和喉嚨腫脹疼痛。壹名8歲女孩因食用花序中毒。她昏迷了12小時，24小時後恢復。馬蹄蓮可以入藥，有清熱解毒的功效。治燙傷，以鮮馬蹄蓮塊莖為宜，搗碎外敷。為了預防破傷風，將馬蹄蓮塊莖搗碎並外敷在傷口處。馬蹄蓮有毒，不宜內服。
應用價值
園林價值:馬蹄蓮花很漂亮，春秋兩季開花，單花期特別長。它是裝飾客廳和書房的好盆花，也是切花、花束和花籃的理想材料。用作切花，長期不可調節，是饋贈親友的禮品花。是熱帶亞熱帶地區花壇的好材料。馬蹄蓮已成為國際花卉市場上重要的切花之壹。
1.用於切花
馬蹄蓮切花的切割與保存:當馬蹄蓮的佛焰苞已經被拉伸到最大限度，卷曲開放時，就可以進行切割了。扡插後，每朵切花的上部用玻璃紙包裹，大小分級，裝箱上市。鮮切花的運輸由於其自身的特點，應註意鮮切花的運輸，避免運輸過程中造成的損傷。長途運輸應以20捆左右為壹個運輸單位，先用塑料袋包裝，再打包運輸。為了節約成本，短途運輸只能用大塑料袋，全部用膠帶紮緊後裝袋運輸。運輸時，應平放在飛機上方，以免被其他物體損壞。
在盆栽植物中使用
馬蹄蓮盆花種植要點:1)。盆栽時要施足底肥，大鱗莖旁留幾個側芽，增加花和葉的密度和觀賞性。2).適當控制澆水，增加通風，保持植物間距，會使植物變得美麗。3)植株間距最終確定後盡量避免移動花盆，保持花盆下的土壤濕潤，使花卉的根系通過花盆下的排水孔紮入下面的土壤中，花卉才能茂盛生長。盆花運輸要點盆花運輸前，先用小塑料袋將花包好，再用報紙將全株包好，避免運輸過程中弄臟花和折斷花、葉的莖，影響觀賞效果。裝車時可水平分層運輸，增加運輸量，降低運輸成本。
3.藥用價值
荸薺蓮有毒，含有大量草藥鈣晶體和生物堿。誤食會出現嗜睡等中毒癥狀。本種為中國植物學圖譜數據庫收錄的無毒植物，毒性為塊莖、佛焰苞、穗狀花序。咀嚼小塊莖會導致舌頭和喉嚨腫脹疼痛。壹名8歲女孩因食用花序中毒。她昏迷了12小時，24小時後恢復。馬蹄蓮可以入藥，有清熱解毒的功效。治燙傷，以鮮馬蹄蓮塊莖為宜，搗碎外敷。為了預防破傷風，將馬蹄蓮塊莖搗碎並外敷在傷口處。馬蹄蓮有毒，不宜內服。