籽播：日本花柏籽播宜於春季進行，用種子繁殖，播前需在低溫下層積處理。當年苗高 10～15cm。
扡插：軟枝、硬枝扡插均可。
壓條：有些品種可進行壓條繁殖。
嫁接：日本花柏嫁接可於晚秋或早春進行，多用側柏作砧木。劈接、靠接、腹樹均可。 采20~30年生開花結實正常的植株作采種母樹。11月采收球果，日曬脫粒，凈種後幹藏，播種地宜選腐殖質豐富的疏松壤土，精細整地。3月間播種，播後覆土蓋草。出土後分次揭草，隨即搭棚遮陽。
苗期管理：在出苗達60%以上時，撤去覆草，使苗木全受光照，若不遇高溫幹旱，壹直進行全光育苗，這樣可比長期遮蔭好，使苗木粗壯、根系發達、抗災力強。苗木出齊後，要及時進行松土除草，以免雜草爭水肥，促進苗木生長。第二年春移植，加強苗圃管理，定期松土、除草、施肥、清溝排漬。秋後或次年春苗高可達30cm。 日本花柏采種時應選15－30年生無病蟲害的健壯母樹。種子10-11月成熟，采收球果後，在曬場攤涼脫粒，經篩選，將采集到的種子裝入袋中，置通風幹燥處貯藏；並將幹燥種子用塑料袋密封，放在木箱等容器內貯藏。
選擇地勢平坦，土壤肥沃、濕潤、疏松的沙壤土、壤土作圃地。施足基肥後整地築床，要精耕細作，打碎泥塊，平整床面。播種季節在3月上旬到中旬。條播育苗，條距15-18厘米，播種溝內要鋪上壹層細土。每畝用種子4-5公斤，發芽率60%。播後要薄土覆蓋，可用焦泥灰蓋種，以仍能見到部分種子為宜，然後蓋草。
10-15天開始發芽，待幼苗大部分出土後，揭除蓋草。幼苗出土後40天內應特別註意保持苗床濕潤。7－9月可每月施化肥1－2次，每畝每次施硫酸銨2－5公斤。1年生苗高10-375px以上，根徑0.2-0.3cm。
也可進行扡插育苗。3-4月從幼樹上剪去1-2年生側枝，插穗長20-25cm，修去下部細枝鱗葉，扡插深度8cm，用手壓緊插後50天生根，按常規進行苗圃肥水管理。2年生苗高30-40cm，根徑粗0.4-0.5cm，可出苗造林。