當收割艾草時，只有莖和葉的頂端必須被切掉。隨著中醫技術的不斷創新，人們對中醫有了新的認識，大部分人都需要中醫治療，導致對艾草的需求越來越大。端午節前後收割壹次艾草，適量澆水施肥，地下根會重新發芽，農歷九月可再次收割，增產增收。從植物的整體藥用特性來看，根和莖的藥用價值有限，無法利用。重點是艾葉的采收和提煉過程。從這個角度來看，自生艾草的收割方式建議保持治本和可持續發展。
大多數的艾草都是從地下的根開始生長和擴展的。收割時，由專業收割機收割。留在地下的根，讓在土裏過冬安全，減少儲存。第二年挖的時候，只需要在密集的地方挖根就可以移植，這樣就降低了種植成本。在采收艾草時，如果是帶根的，摘葉時容易將根沙混入葉片中，影響艾草的品質。
艾草味苦、辛、溫，入脾。苦艾有壹種芳香的氣味。它被幹燥後制成枕頭，有助於睡眠。采摘下來的新艾草，擰成艾草繩，曬幹，可以驅趕蚊蠅。艾葉是中草藥，具有溫經、祛濕、散寒、止血、消炎、平喘、止咳、安胎、抗過敏的作用。