如果以上方法無效,可以加用藥物治療。對於單純性胃食管反流,首選胃腸動力藥。目前常用嗎丁啉,每次10 mg,每日三次,飯前服用;最近推出的西沙必利是壹種全胃腸促動力藥,更適合便秘患者。如果癥狀沒有改善,可加用抗酸藥,如中和胃酸的堿性藥物,或抑制胃酸分泌的H2受體拮抗劑,如西咪替丁(泰維美0.4g/片)、雷尼替丁(150mg/片)、法莫替丁(20mg/片)、尼紮替丁(150mg/片)。大家都喜歡選擇H2受體拮抗劑,因為它具有療效好、給藥方便(早晚服用1片)、副作用小等優點。如果有反流性食管炎,有人主張首選質子泵抑制劑奧美拉唑(20mg/片)和蘭索拉唑(30mg/片),每天1片,療效可靠。必要時結合胃腸動力藥物可增強療效。如果內科治療無效,尤其是年輕患者,可以做胃底折疊術,這個手術也可以在腹腔鏡下做。如果是食管裂孔疝引起的,在肉科治療無效時,也可以做食管裂孔修補,根治疾病。