哈密瓜品種資源豐富。根據成熟度不同，可分為早熟、中熟、晚熟品種。早熟和中熟的叫夏瓜，晚熟的叫冬瓜。早熟品種主要有黃丹子、納西幹、包子可口奇、石天401等。其特點是皮薄肉細，香味濃郁。
哈密瓜分為網狀皮和光滑皮兩種。按成熟度分為早熟瓜、夏瓜、冬瓜等品種。不同品種的瓜有不同的形狀、顏色和皮紋。常見的優良品種有酥心、甜黑眉、電池紅、鐵皮、綠麻皮、網紋香梨、哈密加格達、小青皮、白皮。
哈密瓜有180多個品種，有橢圓形、卵形、紡錘形、長桿形等。大小不壹，從1斤到15-20斤不等；果皮有網狀和光滑兩種；色澤綠、黃、白，果肉白、綠、橙，肉脆、酥、軟，味醇、香、果。稀有品種超過50種。
哈密瓜肉中維生素的含量不遜於其他水果。哈密瓜的新鮮瓜肉中，維生素含量比西瓜高4 ~ 7倍，比蘋果高6倍，比杏高1.3倍。這些成分有利於人體心臟和肝臟的工作以及腸道系統的活動，促進內分泌和造血功能，加強消化過程。