根
木豆的根系由深而壯的木質化主根和分布在淺層土壤中的發達側根組成。在條件允許的情況下，木豆根系可以紮在2m以下，但更多的根系集中在60cm左右的土層中。木豆根系開花前後的生長量基本相等。木豆的根系與株型密切相關，高大緊湊的品種根系更長更深。散生品種的根在土壤中較淺，水平分布，側根較多。
木豆和豇豆的根瘤菌生來就是結瘤的。成熟結節的形狀和大小變化很大，直徑0.2 ~ 2厘米不等，形狀有球形、橢圓形、長圓形或分枝狀。大多數根瘤種植在側根上，位於30厘米的表土中。在深度為120 ~ 150 cm的根上經常發現較小的根瘤，甚至在更深的根上也能發現根瘤。木豆根瘤在播種後120天內連續形成，但提前產生的根瘤也在播種後30天左右開始下降。木豆根瘤的固氮量壹般為每季每公頃42 ~ 90公斤。