具體用法和療程:上尿路感染、癥狀較輕的患者可口服藥物兩周；所有癥狀嚴重、全身狀況不佳的患者都需要靜脈註射抗生素兩周。下尿路感染，壹般口服抗生素就夠了，療程三天。大多數尿道炎患者經治療後會很快恢復，但部分患者可反復發作。最常見的尿道炎是細菌引起的急性尿道炎，所以最常用的藥物是抗生素。通常如果是初次發作的尿道炎或偶發性發作的尿道炎，最常用的藥物是氟喹諾酮類，如左氧氟沙星。其次是頭孢類，如第二代、第三代頭孢，如頭孢克洛、頭孢呋辛、頭孢地尼等，也可治療尿道炎。
大環內酯類藥物，如阿奇黴素、羅紅黴素和地紅黴素，可以治療尿道炎。還有壹些註射治療，如依替米星、環丙沙星或第三代頭孢菌素。如果是慢性尿道炎或慢性尿道炎，或者短期內反復發作的尿道炎，建議做細菌培養，根據細菌種類和藥敏試驗選擇合適的抗生素。尿道炎藥物治療最重要的是在短時間內徹底治愈，避免復發。