1.感染:壹般與結石有因果關系。尿路感染是導致尿液中結石形成的壹個因素。當晶體濃度過高過飽和時，結晶後會形成結石。結石形成後，可導致反復尿路感染，所以結石和感染是相互促進的；
2、排尿不暢:包括上尿路和下尿路不暢，引起尿瀦留或殘余尿量增多。腎尿不能排出，可見於輸尿管梗阻、尿道狹窄、前列腺增生或肥大等。，導致腎積水，輸尿管擴張，膀胱殘余尿過多。如果尿液在尿路內積聚時間過長，容易導致尿液濃度升高，發生感染，從而促進結石的發生；
3.藥物因素:壹些藥物，如頭孢曲松，以及壹些代謝相關的藥物，也容易導致結石形成；
4、代謝異常:如尿酸結石、胱氨酸結石都是尿酸代謝紊亂的形成。此外，還有壹些結石伴有鈣代謝紊亂，可見於甲亢(甲亢)、甲狀旁腺功能亢進(甲狀旁腺功能亢進)等。，而且還容易導致含鈣結石反復出現；
5.先天性尿路畸形:先天性畸形如馬蹄腎、融合腎、異位腎，或腎盂輸尿管連接部畸形等，可導致尿液排出不暢，也是容易導致結石形成的因素。