蘑菇菌種培育方法有分離培養、接種培養、培養液體種。
1、分離培養
這是通過將蘑菇菌種進行母種分離來實現的第壹步培養步驟，壹般來說，有孢子分離法、組織分離法以及基內菌絲分離等方式。根據蘑菇的特性，我們壹般采用多孢分離法：就是把許多孢子接種在同壹培養基上，讓它們***同培育交配，然後獲得優質的食用菌。
2、接種培養
我們在上面的分離培養中已經獲得了優質的母種，但是為了選出優良且高純度的母種，使之成為可利用的原種，我們還需要培養基。所以，壹般來說，要通過菌體的接種培養，發現壹些生活力強，顏色醇正，健壯有力的蘑菇菌絲用來進行原種和栽培種的接種培養。
3、培養液體種
除了質量以外，培育蘑菇菌種以及菌絲的時候也要註意產量，所以這裏采用液體種深層發酵得到菌種的方式可以將產量最大化，縮短整個培育生產的周期，有效地降低成本。
當然，因為現階段的技術尚不成熟，所以這還是實現可食菌種的壹種理想目標，未來隨著科技的發展，相信液體種的作用會得到更大的發揮和發現。