1.小藍莓的果皮和果肉均為紫紅色，果粒較小，果皮較厚，果肉較少，整體較小，而大藍莓的果皮為紫紅色，但果肉呈青白色，果粒較大，果皮較薄，果肉較多。
2.因為生長環境的不同，大藍莓又叫種植藍莓，通過露地栽培、設施栽培、溫室栽培等方法進行人工種植，而小藍莓是純天然的野生藍莓，只零星分布在無汙染的高海拔原始森林中。
3.不同大小的藍莓味道也大不相同。野生的小藍莓因為沒有經過人工選擇，生長緩慢，而且積累了大量的糖分卻有明顯的酸味，所以整體上不是很甜，而人工種植的大藍莓口感偏甜，酸度也比小藍莓低很多。
4.小藍莓的營養價值遠遠超過普通大藍莓，這也是野生藍莓的壹個特點。小藍莓中的花青素含量基本上是人工培養的大藍莓的十倍，這對於以花青素含量高為最大賣點的藍莓來說有著壓倒性的優勢，所以它們的價格明顯會貴很多。