花椒的修剪方法有很多種，在其結果初期，以疏枝為主。此時，椒樹雖已結果，但仍在生長，需要及時從基部剪掉其枝條，壹些過於密集、交叉、重疊的枝條和芽也要適當剪掉，使植株更好地接受光照，促進更好的結果。
2、捷徑
短截是壹種常見的修剪方法，主要是對花椒生長過程中過於旺盛、衰老的主枝進行修復，以減少養分消耗，促進新枝生長。基本上要把主枝剪短2/3，保留2~3個主枝讓它們繼續生長。
3、整形修剪
花椒幼苗定植後，應在當年或第二年進行修剪，在距主幹25~30厘米處剪去頂端，以便萌發更多的側枝，使樹體更加飽滿、旺盛。此時的樹苗比較脆弱，修剪應以輕剪為主，不可短剪。之後保留基部萌出的5~7根枝條，其余全部剪掉。
4.保持強大和削弱
花椒經過25年的生長，將進入衰老期。此時修剪主要以保留強弱為主，集中養分延長植株壽命。需要在生長過程中從基部剪掉壹些細枝、下垂枝、衰老枝，留下強壯枝繼續生長，恢復樹勢，重新生長。