藍鰭金槍魚體長壹般在200 cm左右，可達458 cm，體重約150 kg，可達684 kg。藍鰭金槍魚是壹種非常大的物種，最高的身體靠近第壹背鰭基部的中心。第二背鰭高於第壹背鰭；胸鰭很短，不到頭部長度的80%。有魚鰾。34-43鰓耙。下側與腹側銀白色之間有壹條無色橫線，與柱狀無色點輪流出現。第壹背鰭為黃色或藍色；第二個紅褐色的；臀鰭和尾鰭呈暗黃色，有黑邊；當用作魚時，中央尾龍骨脊是黑色的。
北太平洋藍鰭金槍魚的外觀與大西洋金槍魚幾乎相同，壹些權威人士認為它們屬於兩個獨立的種群。然而，最近的遺傳分析表明，這兩個群體最好被視為足夠的群體。因為這兩個群體沒有被混淆，所以它們被作為單獨的群體來管理。