胡椒具有溫中、燥濕、化痰、解毒和胃的功效，可用於治療胃脘痛、惡心嘔吐、食積、寒濕泄瀉、寒疝腹痛、腮腺炎、睪丸疼痛、食物中毒、瘡瘍、蛇咬傷、狗咬傷等疾病。
辣椒含有辣椒素、辣椒堿、揮發油等物質，可作為驅風健胃劑口服，抗瘧作用較弱。
胡椒堿還具有抗驚厥作用，可用於治療癲癇。
辣椒不宜長期過量食用，尤其是胃熱陰虛、熱盛者，以免扶火傷身。
小劑量的辣椒可以刺激食欲，大劑量則可以刺激胃黏膜，引起充血性炎癥的變化。