扇貝的肉有兩種，壹種是扇貝的內傾肌，呈白色，非常感性，另壹種是分布在內傾肌周圍的肉，紅色，柔軟。
通常扇貝裏面的肉只取內傾的肌肉作為食材，而周圍的紅肉則被丟棄。吃扇貝時，最好只吃圓的扇貝，千萬不要吃內臟。
扇貝本身是安全的水產品。扇貝是濾食性生物，靠吸收海水中的藻類和微生物生長。如果它的生長環境受到汙染或者有毒藻類爆發，它的內臟就會攝入這些物質。
含有毒素或重金屬的海洋貝類壹般與“赤潮”和“海水汙染”有關。
新版食品安全國家標準《食品中汙染物限量》增加了雙殼貝類等水產品的鎘限量標準，要求去除內臟，限量值為2.0 mg/kg。特別提醒，貝類中的泥香腸不適合食用。