根莖是在地下橫向生長和擴展的異常根莖。有明顯的節和節間，其上可長出新枝和不定根。
不定根發生在蓮藕地下莖的所有節上，它從表層土壤以上20-30厘米的土層中吸收養分。種植蓮藕至長出蓮蓬鞭1-2期間，根群短而細。直立葉出現後，各節以上的根群更長、更粗。根團在蓮藕的養分吸收和植株固定中起著重要的作用。如果不斷移動或踐踏根系，蓮藕的生長和形狀都會受到影響。
蓮藕的花叫荷花，是花苞在莖端伸長而成的。荷花的出現因種而異。有的物種花多，有的花少，有的甚至無花，但花的數量也受環境條件的影響。花單生，花萼類似花瓣狀，稱為花被。