普洱茶含有較多的多酚類物質，對胃腸黏膜有壹定的收斂作用。如果妳自己有便秘，喝多了會更嚴重。
普洱茶中的氟會與鈣離子結合形成氟化鈣，抑制十二指腸對鈣的吸收。長期將普洱茶作為日常飲品，可能會導致缺鈣和骨質疏松，骨折後難以恢復。因此，幼兒、孕婦和老人不宜多飲。
普洱茶中含有的茶堿會降低磷酸二酯酶的活性，使胃壁細胞分泌大量胃酸。胃酸過多會刺激潰瘍面的愈合，同時抵消壹些抗酸劑的藥效，不利於疾病的恢復。