水果果皮中的維生素C、果膠、纖維素比果肉中的多，所以壹度提倡吃水果不要削皮。但近年來隨著農業和林業的發展，農藥被廣泛使用。壹些有毒的農藥，比如樂果，噴在水果上就會滲入到水果裏，大部分殘留在果皮裏。所以水果要洗凈去皮後再吃。
除了可以削皮吃的水果，那些不能削皮的水果(如葡萄、草莓等)的正確清洗方法。)是:在清水中滴幾滴餐具洗滌劑，攪拌，然後洗掉瓜果表面的汙垢，放入含有洗滌劑的清水中浸泡10分鐘，取出後瀝幹。
另外，水果不要用酒精消毒。酒精雖然能殺滅水果表面的細菌，但會改變水果的色、香、味。酒精和水果中的酸會降低水果的營養價值。