從分類學的角度來看，靈芝共有86種，分屬靈芝屬、假靈芝屬、枝孢菌屬和網脈靈芝屬。靈芝屬進壹步分為靈芝亞屬、枝孢亞屬和粗柄靈芝亞屬，其中靈芝亞屬又分為靈芝群和靈芝群。從用途上，可分為藥用型和非藥用型兩種。比如熱帶靈芝可以治療心臟病、關節痛、慢性支氣管炎、降血脂。靈芝能補腦健腦，消炎利尿，益胃。樹舌(又名靈芝)能治療食道癌，止痛，清熱，消食，止血，化痰。還有很多非藥用靈芝，如閩南靈芝、貴州靈芝、福建假靈芝、小孢子靈芝等。
從觀感上看，有些靈芝的欣賞價值很高，如熱靈芝，柄長，蓋小，可作為盆景；紫芝，表面紫黑色，有漆壹樣的光澤，有很大的同心凹槽，可以做成盆景出售。