後者由器質性原因引起,可見於生殖系統、神經系統、內分泌系統的嚴重疾病;或因藥物及中毒因素如使用激素類藥物、降壓藥、安眠藥、胃腸解痙藥、治療胃潰瘍的藥物、抗組胺藥、慢性酒精中毒等。幾乎所有的慢性病都會導致暫時性的性欲喪失。
中醫認為性欲低下與心、肝、腎關系最為密切。腎藏真陰真陽,主生殖;肝藏血,主排泄;心藏神,主血。三臟虧虛,腎氣不足以滋養濕溫,肝氣不足以疏泄,實幹不足,筋氣不足以滋養,導致性冷淡,性欲低下。