外觀區別:黑苦蕎外殼呈黑色，脫殼後呈黃褐色，苦蕎外殼呈黃綠色，但脫殼後呈黃褐色；
生長環境的差異:黑苦蕎生長在海拔2500-3500米以上，苦蕎生長在海拔1500米以上，所以黑苦蕎比苦蕎更稀有；
含量差異:黑苦蕎的蘆丁含量是苦蕎的3-5倍，所以黑苦蕎的營養價值遠高於苦蕎，所以原料價格大約是苦蕎的2-3倍；