熏醋的醋酸味可刺激呼吸道粘膜，特別是導致氣管炎、肺氣腫、哮喘患者發病或加重。很多人認為醋有消毒殺菌的作用，可能是因為醋裏有醋酸。
醋的殺菌主要是靠酸。熏醋有兩個好處:改變空氣酸堿度，增加空氣濕度。兩者的意義主要是減少空氣中灰塵等細菌的附著載體，阻斷其傳播途徑。所以原則上熏醋的意義主要是阻斷傳播。