烏魚子內層若非琥珀色或深咖啡色，而出現黑色，嗅聞時也有輕微臭味，或表面有白色斑點，即可能腐敗或發黴，不能再食用。可拿烏魚子對著燈泡，透過光照若呈暗紅色並且通體透明沒有雜質，就表示越新鮮。
多次解凍與冷藏會影響烏魚子品質，因此可依食用狀況，將烏魚子切成每餐需要的量，先逐壹以保鮮膜包裹外層，第二層再包報紙，隔絕異味，也可再放入保鮮盒中冷凍，保存效果更佳。冰存的烏魚子最好能於拆封後30天內食用完畢，風味較佳。