工業明膠生產過程中對有害雜質的要求不高，對原料和生產過程的控制不如食品或藥品嚴格，尤其是皮革加工中的下腳料，經過壹些有毒試劑的處理後，可能含有更多的有毒物質。
工業明膠最常見的有害物質是重金屬，尤其是六價鉻，危害更大。此外，由於生產過程中存在問題，還可能含有鉛、汞、鎘等重金屬，如果被人食用會增加患癌風險。