1、來源不同：木薯澱粉是從熱帶植物木薯的塊根中提取出來的澱粉，而土豆澱粉是從土豆中提取出的澱粉。
2、性質不同：木薯澱粉在遇到熱之後，會變成透明狀，具有壹定的韌性，可以用於多種食物的加工，而土豆澱粉是壹種調味品，在炒菜或者是做湯的時候，可以起到壹個收汁的作用，也可以用於炸制食物時的外層裹料，讓炸出來的食物更松脆。