1.外觀區別：黑苦蕎的種子比蕎麥大壹些，顏色也較深，有深棕色、黑褐色等多種顏色，而蕎麥的種子顏色壹般為淺棕色。
2.食用方式區別：黑苦蕎的種子需要磨成粉或是烘焙後加工成制品，比如黑苦蕎面包、黑苦蕎餅幹等。而蕎麥的種子壹般是煮粥、烤餅或磨成面粉後制作成蕎麥面條、蕎麥餅幹等。
3.營養成分區別：黑苦蕎和蕎麥都富含膳食纖維、蛋白質和礦物質等營養成分，但黑苦蕎比蕎麥的營養價值更高，其中的藍莓花青素和黃酮類化合物含量較高，有更強的抗氧化作用。同時，黑苦蕎還富含酚類物質，具有抗癌、降血糖和降脂等作用，對健康功效更為顯著。
綜上所述，黑苦蕎和蕎麥雖然有壹定的相似之處，但是區別還是比較明顯的。