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納木錯是第三紀末第四紀初喜馬拉雅運動坳陷形成的巨大湖盆。它的形成和發展受地質構造控制，是喜馬拉雅運動坳陷形成的，是有冰川作用痕跡的裂谷湖。後來由於西藏高原氣候逐漸幹燥，納木錯的面積大大減少。現存古湖巖線8~10條，最高的壹條距今湖約80米。
作為世界上海拔最高的最大湖泊，納木錯擁有多種依賴高原湖泊的典型濕地生態類型，包括湖濱沼澤、河口、湖岸淺水、湖岸濕草甸、巖石湖岸、沙質湖岸、沙質島嶼和湖泊等。，並形成了完整的高原濕地群落。
百度百科-納木錯