白豆杉生於亞熱帶中山地區的林下，氣候溫涼濕潤，雲霧重，光照弱，年平均溫12－15℃年降水量1800
－2000毫米，平均相對濕度80%以上。土壤屬山地黃壤，強酸性，Ph值4.2-4.5，有機質含量5.4-18.4%，肥力較高。群落外貌多為常綠－落葉闊葉混交林，在分布區北緣的浙江遂昌九龍山，喬木層主要由木荷SchimasuperbaGardn.etChamp、秀麗槭AcerelegatulumFangetP.L.Chiu、與猴頭杜鵑RhoaodendronsimiarumHance等組成，本種居於下層；在南緣的廣西大明山海拔1300米處，則分布以銀木荷SchimaargentaPritz、甜櫧Castanopsiseyrei(Champ.exBenth)Tutch為建群種的常綠闊葉林。白豆杉為陰性樹種，壹般喜生長在郁閉度高的林蔭下，在幹熱和強光照下生長萎縮，幹形彎曲。根系發達，巖縫內也可紮根，但成叢生灌木。幼年生長緩慢。雌株結實常不穩定，受孕率又低，種子失眠期，需隔年發芽。冬芽於3月中旬膨大，4月上旬展葉；花於3月下旬至4月上旬開放，種子於9月下旬至10月上旬成熟。