酸奶發酵劑主要含有基本發酵菌保加利亞和濕熱鏈球菌。牛奶用作厭氧發酵的底物(主要發酵產物是乳酸)。乳酸發酵的酸奶中的壹些營養成分比鮮奶更容易被人體吸收。
有些酸奶發酵劑含有較多的益生菌,比如雙歧桿菌核仁酸奶發酵劑,它含有六種天然益生菌,除了保加利亞和濕生鏈球菌,還有乳雙歧桿菌、嗜酸乳桿菌、幹酪乳桿菌、
鼠李糖乳桿菌是目前市場上益生菌最多的酸奶發酵劑粉。