探針法是探針與靶序列結合後，探針被聚合酶降解後，探針上的熒光基團離開淬滅基團，從而發出熒光。
從兩種方法的原理不難判斷，熒光PCR法更簡單方便，成本也低。探測方法更具體。
擴展數據:
熒光定量PCR(FQ PCR；);實時定量PCR(RT-qPCR或qPCR).
1996，美國應用生物系統公司引進了壹種新的定量檢測技術。它是用熒光染料或熒光標記的特異性探針標記和跟蹤PCR產物，用相應的軟件分析產物，計算出待測樣品模板的初始濃度，從而實時監測反應。
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