當初瓦崗寨的統治者其實是當時的英雄翟讓，對他特別忠誠，所以很多將領都願意為瓦崗寨效力，包括秦、程等名將，所以當時瓦崗寨的實力是所有起義部隊中最強的。後來李密被朝廷追殺，無奈投靠瓦崗寨。來到瓦崗寨後，李密實際上組建了自己的部隊來代替翟讓。
後來翟家有人看出石米有所圖謀，就想提前殺了石米，誰知後來被石米泄露了。於是李密打算先殺了翟讓，然後在裏面精心策劃了壹場酒席，翟讓自己也沒有太多心機，以為李密只是請他吃飯。後來，翟讓也在席間喝醉了。李密趁翟讓喝醉的時候殺了翟讓，把翟讓全家都殺了。此時，李密成為瓦崗寨的實際統治者。
但是殺了翟讓之後，裏面很多將領也不肯接受這個說法，包括秦的。因為這部分人認為翟讓在李密走投無路的時候收留了他，而現在李密反過來殺了翟讓和他的家人。俗話說不共戴天，所以秦包書毅然離開了李密。失去了這些優秀的將領，瓦崗寨很快就被消滅了。