海南養生堂保健品有限公司成立於7月，1999。公司產品有清口含片、清口小丸子、小火麻仁。
1999 10浙江養生堂天然藥物研究所有限公司註冊成立。
2001北京高新技術企業萬泰生物制藥有限公司加入養生堂股份有限公司
2003年2月，養生堂旗下的北京萬泰生物制藥有限公司與廈大養生堂生物制藥聯合實驗室研發出國內首個HIV快速診斷試劑，並獲得生產許可。
2003年7月，養生堂維生素系列產品正式成為中華醫學會重點推廣項目。
2003年7月，養生堂與香港大學合作研發的戊肝疫苗走向國家壹類新藥。
2004年6月至10月，人事部批準養生堂股份有限公司建立博士後研究中心。