Charles Vancouver Piper（1926）對美洲菜豆族（American Phaseoleae）劃分為8個部分，92個種，這壹體系得到了Urban（1928）、Morton（1944）和其他壹些學者認可。Verdcourt（1970）重新定義了Phaseolus屬和其它相近屬Macroptilium，Ramirezella，分離出了豇豆屬（Vigna）。Marechal（1978a，b；1981）進壹步明確了菜豆屬和豇豆屬的差別，Lackey（1983）認同了這壹較窄的更加明確的菜豆屬範圍。Delgado（1985）進壹步確定了菜豆屬的分類，該屬劃分為4個部分36個種。
目前世界上栽培的菜豆屬豆種有5個，分別是普通菜豆（Phaseolus vulgarisL.）、多花菜豆（Phaseolus coccineusL.）、利馬豆（Phaseolus lunatusL.）、寬葉菜豆（Phaseolus acutifoliusA.Gray.）和叢林菜豆（Phaseolus polyanthusGreenman）。其分類學主要特征和區別見表10-8。
表10-8 菜豆屬分類表
豆種學名區別性狀普通菜豆 Phaseolusvulgaris L.子葉出土；矮生直立、半蔓生、蔓生；葉面葉背均為綠色；粒色十分豐富，有白、黑、黃、灰、褐、花紋（斑）等；百粒重20～80g多花菜豆Phaseoluscoccineus L.子葉不出土；多為蔓生類型；葉面綠而葉背灰綠色；粒色較單壹，主要有白、黑紫花紋（斑）等；籽粒大，百粒重100g以上利馬豆 Phaseoluslunatus L.子葉出土；多為蔓生類型；葉面葉背多為灰綠色，有的品種有明顯的白色條紋，後逐漸消失；粒色較豐富，區別於其他豆種的最大特點是，從種臍向四周有明顯的射線；百粒重40～140g寬葉菜豆 Phaseolusacutifolius A.Gray.粒色以白色、黃色和棕色花斑品種居多；早熟、耐熱、抗旱；蛋白質含量低於普通菜豆（詳細資料尚缺）叢林菜豆 Phaseoluspolyanthus Greenman 植物學性狀類似於多花菜豆，兩者有時混生，但子葉出土。國內外栽培很少。