可食用模式
傳統的做法是先將納豆與醬油或日本芥末(壹般百貨商店出售的盒裝納豆使用日本淡醬油和黃芥末)混合，攪拌至出現絲狀物，盛在白米上，為納豆飯。也有人將納豆與生雞蛋、洋蔥、蓮子、蘿蔔、柴火等食材混合。北海道和東北有時會把納豆和糖混在壹起。用蛋黃醬吃也有創意。如果不攪拌就加醬，水太多，粘度會降低。洋蔥和芥末可以抑制“納豆氨”的刺鼻氣味。不習慣吃納豆的以為是爛煮黃豆。
營養成分
納豆含有大豆的全部營養成分和發酵後添加的特殊營養成分，包括皂甙、異黃酮、不飽和脂肪酸、卵磷脂、葉酸、食用纖維、鈣、鐵、鉀、維生素、多種氨基酸和礦物質，適合長期食用和養生。
據日本醫學家和生理學家介紹，大豆的蛋白質是不溶的，但制成納豆後就變得可溶，並產生氨基酸，而原料中不存在的各種酶會被納豆菌和相關細菌產生，有助於胃中的消化吸收。納豆的成分為:水分61.8%，粗蛋白19.26%，粗脂肪8.17%，碳水化合物6.09%，粗纖維2.2%，灰分1.86%。作為壹種植物性食物，它的粗蛋白和脂肪含量最高。納豆是壹種高蛋白的營養食品。納豆中所含的酶，食用後可消除體內部分膽固醇，分解酸化脂質，使異常血壓恢復正常。